Dados do Trabalho

Título

HLA-B*51:365N, UM NOVO ALELO NULO ENCONTRADO EM UM CANDIDATO A DOAÇAO DE MEDULA OSSEA

Introdução

O gene HLA-B é o gene mais polimórfico do genoma humano com 9274 alelos descritos, sendo que 325 deles alelos nulos (IPD-IMGT/HLA, versão 3.52). Neste trabalho, descrevemos a sequência de um novo alelo HLA-B nulo identificado por sequenciamento de Nova Geração (NGS).

Material e Método

Material genético de um indivíduo sadio foi isolado de sangue periférico (Maxwell RSC Blood DNA) e submetido a protocolo comercial de NGS para 11 genes HLA clássicos (AlloSeq-Tx17, CareDx) na plataforma MiSeq (Illumina). Utilizamos o software AlloSeq Assign para determinar as sequencias consenso e encontrar o melhor genótipo e os softwares NGSengine (versão 2.22.0, GenDx) e HLA Twin (versão 4.4.1, Omixon) para confirmação dos resultados.

Resultados

Após primeira etapa de análise dos dados, os alelos HLA-B determinados foram B*35:01:01 (sem mismatches) e B*51:01:01 com uma substituição no éxon 4 (gDNA 724, códon 218 CAG > TAG) resultando na troca de uma Glutamina por um códon de parada prematuro. A genotipagem HLA completa para esta amostra foi HLA-A*02:01:01, 02:01:01, -C*04:01:01, 14:02:01, -B*35:01:01, 51:novo, -DRB1*01:03:01, 13:01:01, -DQA1*01:01:01, 01:03:01, -DPA1*01:03:01, 02:01:01, -DPB1*04:01P,10:01, -E*01:01:01, 01:01:01, -F*01:01:01, 01:01:01, -G*01:01:01, 01:01:01, -H*01:01, 01:01, MICA*002:01, 049:01, MICB*002:01, 005:03.
Após a suspeita de alelo novo ter sido confirmada pelos softwares citados acima, a nova sequência foi submetida às bases de dados GenBank (OV307907) e IPD-IMGT/HLA (HWS10059992), sendo denominada B*51:365N.

Discussão e Conclusões

O sucesso dos TCTHs depende, dentre outros fatores, da correta identificação de alelos HLA nulos para diminuir a chance ocorrência de eventos adversos como a doença de enxerto contra o hospedeiro.

Palavras Chave

HLA-B; alelo nulo; novo alelo; sequenciamento de nova geração; NGS;