Dados do Trabalho

Título

HAPLOTIPOS ESTENDIDOS NA REGIAO DE HLA CLASSE I E II. INFERENCIA PELO SEQUENCIAMENTO EXOMA DE PORTADORES DE HOMOZIGOSE HLA-A~C~B~DRB1~DQB1~DPB1

Introdução

A região do complexo principal de histocompatibilidade possui a maior diversidade alélica em todo genoma humano. Tem sido possível deduzir os alelos HLA no sequenciamento de exoma (ExS). Nós comparamos as tipagens HLA de 15 participantes do Registro Brasileiro de Doadores de Medula Óssea (REDOME) com homozigose nos locos A-B-DRB1, com as deduções obtidas por sequenciamento do exoma (ExS).

Material e Método

Utilizamos a plataforma HLA Explore™ NGS que possibilitou a identificação dos alelos de HLA-clássicos e não clássicos com dados gerados no sequenciamento de Exoma Illumina. O desequilibrio de ligação foi realizado no software Arlequin versão 3.5.2.

Resultados

Os resultados corroboraram com as análises realizadas possibilitando a dedução do 3º campo. Dez alelos, quando analisados os 6 loci obrigatórios para cadastro no REDOME, não puderam ser deduzidos no ExS e em 39 só foi possível chegar ao resultado em grupo P. Não houve discordância e 5 alelos que apresentavam ambiguidade em NGS com a presença de alelos raros, puderam ser definidos por ExS.
Nós verificamos também o desequilíbrio de ligação dos demais loci Classe I e II dois a dois. Não foi encontrado desequilíbrio de ligação dos alelos do locus HLA-J, com os demais loci de Classe I. Nos loci de classe II, os quatro alelos dos loci DMA e DMB não estavam em associação com os demais loci nem entre si.

Discussão e Conclusões

O locus DPB1 foi o mais polimórfico entre os HLA em participantes com tripla homozigose A~B~DRB1. O ExS junto com algoritmos de desequilíbrio de ligação podem vir a complementar e trazer novas evidencias de alelos e haplótipos associados com ancestralidade e doenças.

Palavras Chave

Exoma, HLA, NGS, homozigose