Dados do Trabalho
Título
FREQUENCIAS ALELICAS E HAPLOTIPICAS HLA POR SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇAO DE DOADORES VOLUNTARIOS DE MEDULA OSSEA NO PARANA
Introdução
A tipificação HLA em alta resolução por NGS (Next Generation Sequencing) é essencial no pré-transplante de medula óssea. Evidências brasileiras das frequências alélicas e haplotípicas são escassas; assim, estudos para caracterização da nossa população em relação a dados de alta resolução de HLA são necessários.
Material e Método
Amostras de sangue de doadores voluntários de medula óssea (DVMO), atendidos pelo Laboratório de Imunogenética da UEM (LIG-UEM), foram submetidas à extração de DNA com kit QIAamp® DNA Blood Mini (Qiagen) e tipificação HLA por NGS com kit AllTypeTM FASTPlexTM (One Lambda), Illumina. As frequências alélicas e haplotípicas foram calculadas no software Arlequin v.3.5.2.
Resultados
Os alelos mais frequentes foram HLA-A*02:01:01 (21,6%), A*24:02:01 (10,1%), A*01:01:01 (9,6%), B*51:01:01 (8,2%), B*35:01:01 (6,9%), B*44:03:01 (6,2%), C*04:01:01 (16,0%), C*07:01:01 (9,9%), C*07:02:01 (8,6%); DRB1*07:01:01 (12,6%), DRB1*03:01:01 (7,0%), DRB1*01:01:01 (6,7%), DQA1*05:05:01 (14,4%), DQA1*01:02:01 (13,2%), DQA1*02:01:01 (10,4%), DQB1*05:01:01 (10,9%), DQB1*02:02:01 (9,1%), DQB1*03:01:01G (8,1%), DPA1*01:03:01 (67,1%), DPA1*02:01:01 (14,5%), DPA1*02:02:02 (4,7%), DPB1*04:01:01 (20,5%), DPB1*02:01:02 (10,3%) e DPB1*04:01:01G (9,3%). Os haplótipos mais frequentes foram A*03:01:01~B*07:02:01~C*07:02:01~DRB1*15:01:01~DQA1*01:02:01~DQB1*06:02:01~DPA1*01:03:01~DPB1*04:01:01 (0,418%), A*01:01:01~B*08:01:01~C*07:01:01~DRB1*03:01:01~DQA1*05:01:01~DQB1*02:01:01~ DPA1*01:03:01~DPB1*04:01:01 (0,376%) e A*24:02:01~B*07:02:01~C*07:02:01~DRB1*15:01:01~DQA1*01:02:01~DQB1*06:02:01~DPA1*01:03:01~DPB1*04:01:01 (0,251%).
Discussão e Conclusões
Esse estudo foi fundamental na caracterização de alelos e haplótipos HLA por alta resolução na população brasileira e na definição da compatibilidade entre doador/receptor de transplantes.
Palavras Chave
Frequências HLA, Populações Brasileiras, Transplante.
Área
HISTOCOMPATIBILIDADE/IMUNOGENÉTICA
Instituições
Universidade Estadual de Maringá - Paraná - Brasil
Autores
ANA PAULA SOKOLOWSKI DE LIMA, CARLOS HENRIQUE DE OLIVEIRA, JULIANO HIROYUKI ITO, FERNANDA PELISSON MASSI, VICTOR HUGO DE SOUZA, QUIRINO ALVES LIMA NETO, LARISSA DANIELLE BAHLS PINTO, JEANE ELIETE LAGUILA VISENTAINER